Inzucht
Von Inzucht spricht man, wenn man sehr eng verwandte Hunde, also etwa Bruder und Schwester, Vater und Tochter usw. verpaart. Man könnte sie auch Inzestzucht nennen, denn wir haben hier alles Verpaarungen des 1. und 2 Grades. Der Vorteil hier ist, dass vorhandene Merkmale, die durch die gemeinsamen Vorfahren existent sind, gefestigt werden. Die Nachkommen werden in vielen Bereichen der Gene reinerbig, da sie von Vater und Mutter dieselben Allele bekommen. Was beim Phänotyp oft wünschenswert ist, kehrt sich beim Genotyp in vielen Bereichen ins Gegenteil, denn natürlich kommen auch die negativen Eigenschaften ans Tageslicht, Erbkrankheiten werden somit gefördert und brechen vermehrt auch aus.
Betrachten wir dies mal am Beispiel PRA. PRA wird autosomal rezessiv vererbt. Das heisst:

• Für einen Befall eines Tieres muss es von beiden Elterntieren jeweils ein defektes Gen erhalten haben.
• Hunde die von den Eltern ein defektes Gen und ein gesundes Gen erhalten haben sind so genannte Träger. Diese Tiere erblinden nicht, das vorhandene gesunde Gen erhält die Sehfunktion aufrecht. Die Augen dieser Tiere sind bei einer tierärztlichen Augenuntersuchung absolut gesund. Sie geben aber wenn mit ihnen gezüchtet wird, das defekte Gen unerkannt an einen Teil ihrer Nachkommen weiter.
• Als dritte Variante gibt es dann noch das absolut gesunde Tier. Es hat von seinen Eltern zwei gesunde Gene erhalten. Es kann auch kein defektes Gen an seine Nachkommen weiter geben

Bei einer Verpaarung im 1. und 2 Verwandtschaftsgrad ist die Wahrscheinlichkeit, dass ihre Nachkommen dieselbe genetische Anordnung für PRA besitzen, wesentlich höher als bei wenig oder nicht verwandten, weil sie statistisch zu 25% dieselben Erbanlagen besitzen. Das bedeutet, dass die beiden verpaarten Hunde äusserlich völlig gesund sind, genetisch aber Träger sind, somit je ein Defektes Gen besitzen. Das gesunde Gen kann die Aufgaben des schadhaften übernehmen, so dass nach aussen keine Wirkung sichtbar ist. Verpaart man nun einen PRA-Träger mit einem gesunden, PRA-freien Hund, besitzen 25% der Nachkommen das PRA-Gen, sind aber äusserlich gesund. Werden nun zwei Geschwister, die beide PRA-Träger sind, miteinander verpaart, so werden im Schnitt 25% der Nachkommen an PRA erkranken.

So wie in diesem Beispiel kann es sich mit fast jeder Erbkrankheit abspielen. In gesunden Linien können plötzlich mannigfaltige Krankheiten ausbrechen, welche vorher nie auftraten. Manche grosse Hundezucht geriet so in eine Sackgasse und man hörte nach wenigen Jahren nichts mehr von Ihr. Inzestzucht ist somit eine der sichersten Methoden eine Hunde-Zucht langfristig zu zerstören.

Link: Ein reales Beispiel, einer heute nicht mehr aktiven Zucht, für eine solche Inzucht-Verpaarung

Linienzucht
Bei der Linienzucht sind die Tiere im 3. bis 4. Grad verwandt. Es sind somit Verpaaren von Grossvater mit Enkeltochter, Neffe mit Tante usw. Es ist somit immer noch eine enge Inzucht, wenn man es genau anschaut.
Auch hier gelten im Prinzip dieselben Problematiken wie bei der Inzestzucht. Die Wahrscheinlichkeit, dass die beiden Allelen eines Gens gleich sind, wird erhöht. Durch die vorschreitende Reinerbigkeit wird die Vielfalt dessen, was der einzelne Hund vererben kann, immer eingeschränkter. Das Positive daran ist, dass das Aussehen der Welpen tendenziell besser voraussagbar ist. Der Züchter erlebt so weniger Überraschungen, wenn er die Linie sehr gut kennt. Es werden jedoch auch unweigerlich verborgen mitgeschleppte, genetische Krankheiten zutage treten. Zuchtlinien welche auf vorgesetzter enger Inzucht basieren, können häufiger Krankheiten auftreten, auch solche welche noch nie auf in der Zuchtlinie vorhanden waren.

Die Linienzucht soll somit mit Bedacht praktiziert werden und wenn es sein muss, dann möglichst nur wenn man das nötige Wissen und die entsprechende Begründung dazu hat. Hier tritt auch die Problematik der "Stardeckrüden" zum Vorschein, alle wollen mit ihm decken und so wird die genetische Vielfalt immer kleiner. Ganze Zuchtlinien sind plötzlich miteinander verwandt und die Züchter können nur hoffen, dass in ein paar Generationen nicht plötzlich Erbkrankheiten auftreten mit denen keiner gerechnet hätte. Deshalb ist neben dem Ahnenstudium eines Deckrüden, auch das studieren der Nachzucht wichtig, sowohl was die Qualität wie auch die Quantität betrifft.
Hans Räber, der weit über die Landesgrenzen anerkannte Kynologe, schreibt in seinem Buch "Brevier neuzeitlicher Hundezucht"; Zitat: "Inzucht ist ein machtvolles Werkzeug, aber in den falschen Händen wie das Messer in der Hand des Affen."

Die Auskreuzung
Ein wichtiges Instrument in der Linienzucht ist das gezielte Auskreuzen von Zuchtlinien. Man Verpaart da liniengezüchtete Collies aus verschiednen Linien, welche untereinander nicht verwandt sind. Man verpaart somit eine liniengezüchtete Hündin mit einem genetisch fremden, selbst aber auch in seiner Linie relativ eng gezüchteter Rüde, um daraus einen neuen Impuls für die eigene Zucht zu gewinnen. Diese Paarungen bringen durch den Heterosiseffekt oft sehr schöne und besonders typische und gesunde Nachkommen hervor. In der neuen Linie werden voraussichtlich keine besonders starken Vererber dabei sein, da sie wahrscheinlich einen sehr hohen Anteil an heterozygoten Genen besitzen. In der Nachzucht wird diese Linie dann wahrscheinlich unterschiedlichere, weniger einheitliche Welpen hervorbringen als andere Linien mit weniger gemischten Genen. Dies wird sich dann auch bei der Weiterzucht mit dieser Linie fortsetzen, bis sich die Gene wieder in einer bestimmte Richtung gefestigt haben. Die beiden ursprünglichen Linien der Elterntiere sollten dann möglichst getrennt weitergeführt werden.

Fremdzucht
Die Fremdzucht ist eine Verpaarung von Hunden welche über mehr als 6 Generationen keine gemeinsamen Verwandten haben. Solche Verpaarungen sind nur schwer einzuschätzen es brauch sehr viel Kenntnisse und eine Menge Zuchterfahrung um gute Resultate zu bekommen. Die Würfe werden mit grosser Wahrscheinlichkeit Welpen mit recht unterschiedlichen Phänotypen hervorbringen, wobei sie Gesundheitlich meist sehr Robust sind. Solche Verpaarungen setzen ein intensives Studium der Eltertiere voraus und sollte auch nur mit qualitativ sehr hochwertigen Hunden gemacht werden. Geschickt eingesetzt kann das Resultat einer Fremdzucht die Qualität der Eltern übertreffen und somit die Rasse weiter bringen.

Kreuzungszucht (Crossbreed)
Beim Crossbreed, oder in der deutschen Sprache die Kreuzungszucht, wird eine andere Rasse einkreuzen. Diese Kreuzungsart wir meist nur zu Beginn einer Rasse angewandt und sollte bei einer verantwortungsvollen Rassenzucht später nicht mehr notwendig sein. Wird sie bei einer gestandenen Rasse notwendig, so wurden im Vorfeld schwere Fehler gemacht, welche den Genpool einer Rasse unnötiger Weise einschränkte oder die Zuchtpopulation war von Anfang an zu klein, um eine Rasse gesund zu behalten. Beim Collie wurde zu Beginn, im Zeitraum von 1850 bis 1870, wahrscheinlich Einkreuzungen von Settern (Gordon und Irish) vorgenommen und Queen Victoria kreuzte gezielt den russischen Windhunden (Barsoi) ein. Sie züchtete so den schmalen, langen Kopf und die schlanke, elegante Figur in die Rasse ein. Da bei einer so verbreiteten Rasse, wie es der Collie ist, der Genpool gross genug sein sollte für eine vernünftige Zucht, werden solche drastische Massnahmen wohl auch in Zukunft nicht mehr nötig sein. Die meisten Länder, in Europa und Übersee, haben verschiedenste Zuchtlinien, welche von den Züchtern verantwortungsvoll weiter geführt werden. Die allermeisten Zuchtvereine tragen die entsprechend Verantwortung, um die genetischen Vielfalt in der Collie-Zucht beizubehalten. So sollte der Genpool gross genug bleiben.